海豹油通常以膠囊的形式服用，一般建議的服用量爲每日1至2次，每次1至2粒。關於服用的最佳時間，有不同的建議：
可以飯前服用，這樣更利於減肥瘦身，如果配合普洱茶或其他飲品，減肥效果會更佳。
可以飯後服用，這樣對降低血糖有較好效果，適合高血糖患者。
可以飯中服用，這對降血脂、改善心腦血管健康有益。
需要注意的是，海豹油本身是油脂提取物，所以服用後不宜大量飲水。此外，海豹油作爲保健品，對食物沒有特別禁忌，保持少喫多餐的飲食習慣即可。最後，儘管海豹油有多種食用方法，但作爲保健品，不建議長期過量服用，以避免增加腎臟負擔，兩次服用間隔不少於6小時。