深海魚油通常建議在飯後服用，這樣做可以減少對胃腸道的刺激。此外，爲了更好地利用深海魚油的功效，建議在晚上服用，因爲晚上是人體合成膽固醇的高峯時段，此時服用深海魚油可以幫助降低膽固醇，從而預防心血管疾病。