澎湖水道位於澎湖列島與台灣本島之間，南北長約65公里，寬約46公里。這個海峽是由地殼斷裂形成的峽谷。水深從北部開始，大約70米，逐漸向南增加至160米。繼續向南，水深達到1000餘米，這是海峽的最深處，也是連通南海海盆的地方。