澱粉粒的結構主要包括以下幾個方面：
形態結構。澱粉粒的形狀和大小因來源不同而有所差異。常見的形狀包括圓形、橢圓形、多面體形、類圓球形、棒槌形等。
晶體結構。澱粉粒是由直鏈澱粉和支鏈澱粉分子徑向排列而成的，具有結晶區與非結晶區交替層的結構。這些分子通過氫鍵結合，形成不同的結晶形態，如A、B、C型。
層紋和臍點。澱粉粒外部通常有層紋結構，這些層紋圍繞一個稱為臍點的中心點。層紋是由晶態的支鏈澱粉與非晶態的直鏈澱粉交替排列形成的，而臍點是澱粉粒生長的原點。
偏光現象。在偏光顯微鏡下觀察，澱粉粒呈現黑色的十字而分成四個白色的區域，這種現象稱為偏光十字。
這些特徵共同構成了澱粉粒的複雜結構，對其功能和性質有重要影響。