《火影忍者》中的反派人物包括:
宇智波斑。曾是宇智波一族的首領,實力極強,但在與千手柱間的交戰中敗北,後復活參與第四次忍界大戰,最終在發動無限月讀時被黑絕殺害。
再不斬。被稱為「鬼人」,是早期故事中的主要反派,後被鳴人感化,最終封印。
大蛇丸。木葉村的忍者,對忍術力量極度痴迷,研究禁術,造成許多犧牲,後期改邪歸正,被允許繼續研究但不傷害他人。
漩渦長門(佩恩)。原是自來也的弟子,後成為曉組織首領,企圖通過痛苦來喚醒世界的和平,最終被鳴人感化。
宇智波帶土。最初作為長門的傀儡,後成為曉組織的重要角色,夢想創造一個有琳的世界,最終為鳴人犧牲。
赤砂之蠍。砂忍者村的天才傀儡師,因父母被殺而性格扭曲,加入曉組織,後在戰鬥中自殺。
此外,《火影忍者》中的反派人物還有許多其他角色,如迪達拉等。