在《火影忍者手遊》中，秘境探險是一種特殊的遊戲玩法，它為玩家提供了挑戰神秘BOSS的機會，並有助於提升遊戲角色的實力。
秘境探險的具體作用包括：
挑戰BOSS。玩家可以組隊或單獨挑戰秘境中的BOSS，每個秘境都有其獨特的BOSS，例如烈炎秘境的BOSS是烈火之忍偶。
獲得獎勵。通關秘境後可以獲得秘境獎勵，這些獎勵包括但不限於飾品、銅幣、聲望等。不同難度下的秘境掉落獎勵的品質也不同，難度越高，掉落的獎勵品質也越高。
提升戰力。通過積累飾品和其他獎勵，玩家可以提升自己的戰力和抗魔值，為挑戰更高難度的秘境做準備。
增加遊戲樂趣。秘境探險的玩法增加了遊戲的挑戰性和趣味性，讓玩家在探索和挑戰中享受遊戲的快樂。
此外，秘境探險還有次數限制，每天凌晨5點刷新挑戰次數。玩家可以通過消耗金幣來使獎勵翻倍，從而在通關時獲得更豐厚的獎勵。