灰原哀在《名偵探柯南》中的出場集數包括但不限於以下：
第129集《大學教授殺人事件》。
第136集至第139集《黑暗組織來的女子大學教授殺人事件》。
第140集《SOS!步美傳達的訊息》。
第156集至第157集《本廳刑事戀愛物語》。
第190集至第192集《與黑暗組織再次重逢》。
第203集至第209集《危命的復活》。
第220集至第221集《本廳刑事戀愛物語3》。
第228集至第229集《蘑菇、山熊與偵探隊》。
第244集《生意興隆的秘密》。
第371集至第375集《與黑衣組織面對面對決滿月之夜的雙重事件》。
第435集《珠寶強盜現行犯上集》。
第459集至第463集《黑色衝擊！組織之魔爪觸碰的瞬間》。
第539集至第550集《紅與黑的碰撞血緣》。
第572集至第573集《新一的真實身份和小蘭的眼淚》。
第753集至第756集《漆黑的神秘列車》。
此外，還有第521集、第522集、第523集、第542集、第534集、第563集、第557集等。