皇帝被稱爲"九五至尊"的原因在於數字"九"和"五"在中國傳統文化中的特殊象徵意義。數字"九"在陽數中是最大的，代表着最大、最多、最高的意義，被稱爲“天地之至數”。而數字"五"則因爲在一到九中位於正中，符閤中庸之道，被賦予了崇高而又無比美好的意義。古人認爲"九五"組合是陽中之陽，象徵皇帝至高無上的權威，寓意崇高而深刻。
此外，"九五"這一概念也來源於《易經·乾卦》中的“九五飛龍在天。利見大人”，這一卦辭象徵着聖人有龍德飛騰而居天位，是最吉利的卦象。而其他幾種卦象都沒說龍在天上，最高的"上九"則是"亢龍"，常常意味着傾、覆、亡、敗、退，顯然皆不吉利，因此不能用於皇帝。
最後，"九五至尊"這個詞還與中國的龍脈有關。相傳中國有十四條龍脈，九條山龍與五條水龍，構成了整個中國的龍脈地圖，因此皇帝被稱爲九五之尊。