使用農藥的主要原因是爲了防治農作物、林木、草原的病蟲害，以及衛生害蟲和外來入侵有害生物，以保護糧食生產，保障國家糧食安全和重要農產品的有效供給，促進農民增收和生態環境安全。
通過合理科學地使用農藥，可以提高防治效果，延緩有害生物產生抗藥性或擴大使用範圍，兼治不同種類的有害生物，節省人力和用藥量，降低成本，提高藥效，降低毒性，增強對人、畜的安全性。
然而，農藥的不科學、不合理使用可能會對生態環境造成不良影響，如可能導致一些有益生物減少，影響生物多樣性；有的農藥不易降解，長期大量使用，可能在環境中累積，對土壤、水體等造成一定程度的污染。因此，需要全面認識農藥的利與弊，積極推進綠色防控、專業化防治和科學安全用藥，趨利避害，儘可能降低農藥對生態環境帶來的不良影響。