烏龜喂藥的方法有多種，選擇哪種方式取決於烏龜的健康狀況、食慾以及藥物的形式。以下是幾種常用的給烏龜喂藥的方法：
口服法。適用於還能喫食的烏龜。可以將藥物埋入食物中，讓烏龜自行吞食。如果烏龜已經很少喫食或不食，可以強行填喂。先將烏龜豎起，拉住前肢，當烏龜張開嘴時，迅速將藥餌（含藥的飼料）塞入其嗓子眼使其吞下。
注射法。包括肌肉注射和腹腔注射。這種方法適用於需要快速見效的情況。注射部位通常在後肢的大腿部或後腿拉出後的凸起處。注射後，通常需要觀察烏龜的活動情況，確保沒有不適。
浸泡法。適用於治療體表疾病或需要內服藥物的烏龜。將烏龜放入含有藥物的溶液中浸泡一段時間，這種方法溫和且適用於大面積體表問題。
塗抹法。適用於治療體表傷口或疾病。首先清潔患處，然後塗抹藥膏或藥粉，對於較深的傷口可用藥棉蘸藥粉直接放置於病竈中。
遍灑法。在養龜池中灑上藥物，使烏龜入水後就能接觸到藥物，達到治療目的。這種方法適用於大面積的疾病治療，但需要準確計算藥量。
此外，有些藥物可以溶解在水中供烏龜飲用。對於特別不配合的烏龜，可能需要強制喂藥，這通常涉及將烏龜固定，然後迅速將藥物喂入其口中。強制喂藥時需要小心，避免被咬傷。