牛蒡的保存方法有多種，可以根據需要選擇合適的方式：
冷藏保存。使用報紙或廚房紙巾包裹牛蒡，放入塑膠袋中，排除空氣後密封，放入冰櫃冷藏室，這樣可以延長牛蒡的保質期。
冷凍保存。將牛蒡洗淨、去皮、切成適當大小，放入密封袋中，然後放入冰櫃冷凍室，冷凍保存的牛蒡可以長期保存，需要時直接取出解凍即可。也可以先將牛蒡煮熟後再保存，這樣不僅能延長保存期限，而且烹調時也只需解凍即可使用。
乾燥保存。將牛蒡切成薄片，放在通風良好的地方晾乾，或使用乾燥劑輔助乾燥，乾燥後的牛蒡可以長期保存，使用時將其浸泡在水中恢復水分即可。
醃製保存。將牛蒡切成適當大小，加入適量的鹽醃製一段時間後放入密封容器中冷藏保存，醃製可以抑制細菌生長，延長牛蒡的保質期。
避光保存。應避免陽光直射，因為陽光會加速牛蒡的水分蒸發和營養成分的流失，可以將牛蒡放在陰涼通風處保存。
在保存牛蒡之前，要確保牛蒡的表面乾燥、無損傷。