玉米自交系是通過將單個玉米植株進行連續自交多代，並經過選擇和淘汰的過程，最終得到基因型相對純合的後代。
在玉米育種過程中，自交系的作用非常重要，它們可以通過自交繁殖來保持品種的穩定性，剔除異質性並減少雜質的影響，從而提高品種的純度和穩定性。自交系不僅是構建復交群體的關鍵環節，可以通過不同自交系之間的雜交來增加雜合優勢，提高玉米品種的產量和抗逆性，而且在玉米種子生產中也扮演著重要角色。由於自交系是純合的，它們可以通過不同的雜交組合來產生各種不同的玉米品種。此外，自交系也是製備玉米雜交種子的重要材料，有助於確保種子質量的穩定性和純度。
需要注意的是，在自交繁殖過程中可能會遇到自交抑制和基因縮減等問題，這些問題可能會影響品種的穩定性和適應性。因此，在利用自交系進行育種改良時，需要考慮到這些潛在問題，並採取合理的處理措施。