保存珍珠奶茶時，應注意以下幾點：
未開封的珍珠奶茶應放置在冰箱的冷藏室中保存，以保持其口感和營養價值，避免放置在冷凍室中，因爲這可能會影響奶茶的質地和味道。
開封后的珍珠奶茶應在短時間內飲用完畢，如果暫時無法飲用，應使用保鮮膜密封並放置在冰箱冷藏室內，以延長其保鮮時間，但最好不要超過一天。
自制的珍珠奶茶珍珠保質期較短，建議在4個小時內食用完畢，若需保存更長時間，可以煮沸後加入沸水中再煮2至3分鐘，然後衝冷水，這樣可以使珍珠保持軟糯狀態，但可能會影響口感，也可以使用防腐劑來延長保存時間，但這通常不建議，因爲可能會影響珍珠的質地和口感，對身體也不利。
購買的珍珠奶茶通常已經用塑膠袋密封，未開封時只需放置在陰涼處即可。