珍珠的形成主要有兩種原因，分別是生理性原因和病理性原因。以下是這兩種原因的詳細介紹：
生理性原因。當貝類動物的貝殼被外來物質（如沙粒或寄生蟲）侵入時，貝殼內的外套膜受到刺激，這部分外套膜開始分泌珍珠質，將侵入的異物層層包裹起來，最終形成珍珠。這種珍珠內部通常有核，即外來物質。
病理性原因。貝類動物在生病或受損時，外套膜的部分細胞異常分裂並陷入結締組織中，形成珍珠囊，隨後珍珠囊細胞分泌珍珠質，形成珍珠。這種珍珠通常沒有核心。
此外，人為干預下也能形成特殊的珍珠，如通過手術將珠蚌外套膜的一部分與珍珠囊分離，讓其繼續分泌珍珠質，形成再生珍珠；或在珠蚌殼體內側植入非球形珠核，覆蓋一層天然鈣質膜形成附殼珍珠。