製作甜菜根酵素的方法如下：
準備材料。甜菜根、檸檬、白砂糖以及一個乾淨的密封玻璃罐或酵素桶。
清洗材料。甜菜根用刷子在流水下洗淨，擦乾表皮；檸檬用鹽搓洗後，同樣擦乾。
切片。甜菜根切成約1cm厚的圓片；檸檬去皮後切成圓片，如有籽則需剔除。
準備糖漿。在罐底鋪一層白糖，然後交替鋪上甜菜根片和檸檬片，再鋪上一層白糖，確保每層都緊密接觸，直至材料填滿罐子的大約70%。
密封發酵。在罐口蓋一張保鮮膜，並用牙籤在其上戳很多小孔，然後虛蓋上蓋子，放在通風陰涼處。
每天攪拌。每天進行一次開蓋、攪拌，將沉澱於底部的糖充分攪拌，使其溶解。
發酵時間。發酵過程大約需要7天，當材料全部浮起，表面出現許多氣泡時，酵素即製作完成。
過濾保存。過濾掉渣滓，將酵素原液倒入消毒過的瓶子中，放入冰櫃或在陰涼處保存。
注意，根據個人口味和需求，可以調整糖的比例和添加其他食材，如蘋果。發酵過程中的溫度和時間是關鍵因素，影響酵素的口感和效果。