在《口袋妖怪白2》的二周目中，劇情和冒險繼續升級，以下是詳細的攻略流程：
圖鑑升級：首先，紅豆杉博士的父親會來到你的家中，將圖鑑升級為全國圖鑑，以便捕捉更多種類的口袋妖怪。
遇見勁敵及其妹妹：出門後，你會遇到勁敵和他的妹妹。勁敵的妹妹會夢到一隻索羅亞克在冠軍之路等待你，這是一個重要的線索。
探索飛雲市：來到飛雲市，通過天箭之橋到達矢車森林。在那裡，你會遇到切林，並與他一起調查等離子團的蹤跡。在深處，你會遇到七賢人之一的阿斯拉，他曾與蓋奇斯有過衝突，現在已改過自新。
前往七寶市：穿過矢車森林，來到七寶市。在博物館，蘆薈會讓你選擇羽毛化石或龜殼化石。之後，副館長會帶你參觀博物館。如果你與黑白版本有過聯動，可以觸發與蘆薈、亞堤、亞坤三人的回憶劇情。
三曜市冒險：來到三曜市，可以與天桐、伯特、寇恩三人進行聯動劇情，如果與黑白版本進行過聯動，可以觸發他們與暗之三位一體交戰的回憶劇情。在這裡，你還可以與他們進行雙打對戰。
夢之跡地：從三曜市向右來到夢之跡地，遇到拉迪歐斯/拉帝亞斯（根據遊戲版本不同），經過追逐後發生戰鬥。
聯動劇情：如果你與黑白版本進行過聯動，唐草鎮的NPC會告訴你2年前鹿子鎮出生的前作主角與等離子團戰鬥拯救合眾的事。
以上就是《口袋妖怪白2》二周目的主要攻略流程。記得在冒險過程中捕捉稀有口袋妖怪，並與遇到的NPC對話，了解更多關於合眾地區的故事。