使用眼線膠筆的方法有多種，下面是一種常見的使用步驟：
畫內眼線。將眼線膠筆橫着貼近睫毛根部的位置，分別在眼頭、眼角、眼尾的位置進行描繪眼線，連接這三條線並填滿顏色。
勾勒臥蠶。用棕色眼線膠筆在眼下0.5釐米的位置輕輕勾勒出臥蠶陰影，然後用扁頭刷進行暈染，使臥蠶看起來更加自然。
畫眼瞼下至線。使用遮瑕刷和遮瑕產品，先畫眼瞼下至線，再用遮瑕產品提亮內側。
畫柔霧眼線。先用膠筆畫出短線，再用眼線刷或指甲調整尾部，以創造出柔霧般的自然效果。
在使用眼線膠筆時，可以將鏡子放在距身體20釐米處，眼睛向下看，用無名指把眼皮向上拉。貼着睫毛根部，由眼尾向眼角分段描畫，每一段保持在2毫米左右。先用食指將眼角向鼻部方向拉，然後再從眼角描畫至眼尾，使眼線看上去纖細。用無名指輕拉下眼皮，然後再緊貼睫毛從眼尾到眼角描畫下眼線。用眼線筆沿着睫毛根描畫至眼角，製造出眼角處的眼線漸漸消失的效果。用手把棉棒頭壓扁，從眼角至眼尾將眼線推勻，使線條清晰。這些步驟可以幫助畫出自然、精緻的眼妝。