磷壁酸是革蘭氏陽性菌細胞壁的主要組成成分，具有多種重要的生理功能。它的主要功能包括：
提高細胞膜上合成酶的活性。通過其帶負電荷的分子，磷壁酸能夠與環境中如鎂離子等陽離子結合，從而提高這些離子的濃度，保證細胞膜上一些合成酶維持高活性的需要。
作為貯藏磷元素的庫。磷壁酸在細胞內儲存磷元素，這對於細胞的代謝和生長至關重要。
調節細胞內自溶素的活力。這有助於防止細胞因自溶而死亡，確保細胞的完整性和穩定性。
作為噬菌體的特異性吸附受體。磷壁酸賦予某些細菌對噬菌體的抵抗力，從而保護細菌免受噬菌體的感染。
增強某些致病菌對宿主細胞的粘連。這有助於致病菌與宿主細胞相互作用，避免被白細胞吞噬，以及抵抗宿主的免疫系統。
賦予G⁺細菌特異的表面抗原。這對於菌種的鑑定和識別具有重要意義。
增強某些致病菌對宿主細胞的粘連和抗補體的作用。這有助於致病菌在宿主體內的生存和繁殖。
此外，磷壁酸還參與肽聚糖的加固，有助於加固和保護細胞壁。