移液管的清洗對於保證實驗結果的準確性和可靠性至關重要。在清洗移液管前，應檢查管口和尖嘴是否有破損，若有則不應使用。清洗時應遵循以下步驟：
初步清洗。使用待洗溶液潤洗三次，確保移液管內部和下部外壁不掛水珠。
預處理。將移液管放入70%至75%的乙醇中離心5至10分鐘，然後使用紫外線燈箱進行消毒。
清洗。可使用超音波清洗、鉻酸洗液、洗滌劑或75%乙醇進行清洗。超音波清洗能有效去除內部污垢，而鉻酸洗液和洗滌劑適用於去除頑固污漬。使用洗滌劑時，需注意清洗時間和洗滌劑的濃度。
沖洗和乾燥。用自來水沖洗移液管內外的殘留物質，直至乾淨，然後用去離子水沖洗3次。確保移液管完全乾燥，避免使用過熱的氣流吹乾以防變形或損壞。
此外，高溫高壓滅菌也是一種有效的清潔方法。在所有清洗步驟完成後，應使用待裝入的溶液再次洗滌移液管，以去除所有可能影響實驗結果的殘留物。