立體顯微鏡，也稱爲實體顯微鏡或解剖鏡，是一種特殊的顯微鏡，能夠提供正立的三維空間影像，使觀察者感受到物體的立體感。
立體顯微鏡適用於多種場合，如材料科學、生物學、醫學、工業製造以及海洋生物等領域，在電子工業、醫學檢驗、印刷電路板檢測、以及各種需要精確觀察和操作的場合中發揮着重要作用。立體顯微鏡的特點包括其能夠產生具有三維立體感的圖像，這些圖像是直立的，便於操作和解剖，而且這種顯微鏡具有較長的工作距離和大的焦深，可以觀察被檢物體的全層，同時，它們的視場直徑也較大，使得觀察更加寬廣。立體顯微鏡通常配備雙目鏡筒，可以在不使用特殊眼鏡的情況下實現3D觀察，一些立體顯微鏡還配備有測量軟件，可以用於測量各種數據。