章節附注和參考文獻是兩種不同的文檔格式元素，它們在文檔中的位置和用途有所不同：
位置：
章節附注：位於文檔的末尾，通常是在文檔的最後一頁。
腳註：位於頁面的底部，可以理解為文腳註釋。
用途：
章節附注：主要用於文中標註出處，方便讀者查找相關資料，並用於區分論文中的引用與抄襲。如果標記章節附注，並且序號與參考文獻序號一致，那麼複製貼上的原文就不會判定為抄襲。
參考文獻：主要列在論文結尾處，全面展示研究背景並提高論文的可信度。參考文獻包括正式發表在出版物上的文獻，如書和文章，以及按照首字音序排列、分類再排序等多種方式排列。
格式：
章節附注：屬於格式上的劃分，通常包含作者、標題、出版信息等。
參考文獻：則是論文內容上的劃分，通常包含作者、標題、出版信息、頁碼等。
綜上所述，章節附注和參考文獻雖然在某些情況下可以相互轉換，但它們在文檔中的位置和用途是有區別的。章節附注主要用於文中標註出處，而參考文獻則主要列在論文結尾處，全面展示研究背景並提高論文的可信度。