第三方契約的使用可能帶來一些不利影響，主要包括：
員工歸屬感降低。員工可能感覺自己與實際僱主之間沒有直接的關係，這可能導致員工對工作的投入和效率降低。
管理難度增加。實際僱主可能需要投入更多的時間和精力來培訓和管理通過第三方契約招聘的員工。
法律風險增加。第三方契約可能增加法律方面的風險，如派遣公司或中介公司與員工簽訂的契約存在問題或發生糾紛，實際僱主可能會受到影響。
服務質量風險。第三方公司的服務質量可能因公司而異，提供的人員不符合要求或績效不佳可能會對僱主的業務產生負面影響。
員工權益受損。存在派遣機構剋扣員工工資或社會保險費用，或向員工收取費用的可能性，損害員工的權益。
溝通障礙。由於第三方公司的存在，用工單位與員工之間的溝通可能受到一定阻礙，影響工作效率。
薪酬福利差異。第三方公司的員工在薪酬福利方面可能低於實際用工單位的正式員工，這可能導致員工滿意度下降。
以上這些因素表明，雖然第三方契約提供了靈活性等優勢，但也需要對上述問題進行妥善管理，以避免對業務產生負面影響。