糖原染色的原理基於過碘酸和雪夫液（Schiff試劑）的反應，以下是詳細介紹：
過碘酸是一種氧化劑，它能氧化糖類及有關物質中的1,2-乙二醇基使之變為二醛。
醛基與雪夫液中的無色品紅結合，形成紫色或紅色化合物，這種化合物定位於細胞質中，沉澱的顏色深淺與細胞中起反應的1,2-乙二醇基的量呈正比。
這種染色方法主要用於檢測組織或細胞中存在的糖原、糖胺聚糖和其他富含多糖的物質，常用於病理學領域，特別是在肝臟、腎臟、腸道和神經組織等器官的研究中，可以幫助鑑定和評估許多疾病和病理變化，如糖原儲存病、肝臟疾病、某些腫瘤、炎症和纖維化等。