紀念鈔的保存方法主要取決於其狀態，單張的紀念鈔可以使用紙幣膠套進行保護，整刀的紀念鈔則適合使用刀幣盒進行存儲保護。
爲保持紀念鈔的品相，避免軟折、硬折或污漬，在處理紀念鈔時，應避免與手直接接觸，以防汗液和污垢污染，如果需要拿取，最好使用手套。另外，可以使用專用的塑料袋或紙質護幣袋作爲保護袋，或者將整刀（例如100張）的紀念鈔存放在紙質的收藏袋中。
爲防止氧化和潮溼，可以將紀念鈔放在樂扣盒子或鐵盒中，並添加防潮劑。如果條件允許，可以選擇封裝公司對紀念鈔進行專業封裝和評級，使用高質量的環保材料製成的幣盒或幣套來最大程度地阻止氧化，並提升藏品的透明度。