老鼠品系主要分為封閉群和近交系兩大類。
封閉群包括：
Wistar。起源於1907年美國Wistar研究所，特徵為頭部較寬、耳朵較長、尾長小於身長，性周期穩定、繁殖力強、產仔多，平均每胎產仔10隻左右，生長發育快，性情溫順，對傳染病的抵抗力較強，自發腫瘤發生率較低。
Sprague Dawley(SD)。起源於1925年美國Sprague Dawley農場，特點為頭部狹長，尾長接近身長，產仔多，生長發育較Wistar快，抗病能力尤以對呼吸系統疾病的抵抗力強，自發腫瘤率低，對性激素感受性高。
近交系包括：
ACI。起源於1926年哥倫比亞大學腫瘤研究所Curtis和Dunning培育，特徵為毛色為黑色、腹和腳白色，有遺傳缺陷，如缺少一側腎或發育不全或囊腫，雄性同側睪丸萎縮，雌性無子宮或有缺陷，有自發腫瘤。
BN。起源於1958年Silvers和Billingham用D.H.King和P.Aptekman培育而成，特徵為棕色，有組織相容性基因，抗實驗性過敏性腦膜炎，有心內膜疾病發生率，有上皮腫瘤和輸尿管腫瘤，膀胱和胰腺腫瘤，雌鼠腦垂體腺瘤、子宮腫瘤、腎上腺皮質腺瘤、宮頸肉瘤、乳腺纖維腺瘤、胰腺腺瘤。
F344。起源於1920年Curtis和Dunning在哥倫比亞大學研究所做癌症研究時研發得到該品系，特徵為毛色為白色。
此外，還有許多其他品系的老鼠，如白色、灰色、棕色、黃色、黑色等，這些品系的老鼠常用於腫瘤研究、研究各種人類疾病、供藥物和代謝等研究。