考成法在施行過程中存在一些弊端：
操之過急：張居正將錢穀徵收和土地清丈作為官員考核的唯一標準，導致官員為了升官發財，在追征賦役和清丈土地的過程中採取極端手段，如強迫百姓在規定期限內完納賦役，造成嚴重負擔。
考核標準缺乏彈性：考成法以單一的徵稅數字指標作為考核標準，導致官員追求短期利益，忽視長遠發展。這種做法破壞了民間經濟，使得稅賦沉重，農民破產，進一步增加了徵稅的困難和殘酷性。
促進作用弱：考成法缺乏與被考評者的溝通和反饋，不能有效地通過輔導提高個人和組織績效。它僅僅是對表現進行評價，而沒有發揮考核的促進作用。
綜上所述，考成法在實施過程中過於急功近利，考核標準單一且缺乏彈性，以及促進作用不足，這些都是其顯著的弊端。