花甲吐沙後的保存方法有幾種，可以根據需要選擇的保存時間來進行選擇：
短時間保存。將花甲放入水盆中，加入適量的食用鹽模擬海水環境，放在陰涼處。或者使用保鮮盒或保鮮袋，加入少量水和花甲，放入冰箱冷藏室，這種方法適用於一到兩天的短期保存。
中期保存。將吐沙後的花甲清洗乾淨，瀝乾水分後放入保鮮袋中，加入少量鹽和水，密封后放入冰箱冷凍室，這種方法適用於幾天到一週左右的保存。
長期保存。可以將花甲煮熟後剝肉，瀝乾水分放入保鮮袋中冷藏保存。這種方法適用於長時間的保存，例如一箇月以上。
此外，還可以使用醃製的方法，用鹽醃製花甲後放在陰涼處，需要食用時清洗乾淨。