花蓮鯉魚潭鬼故事有以下兩種說法：
* 一種是說很久以前鯉魚潭底有妖怪，經常在月圓之夜出來吃人，後來一個道士用計降妖后，妖怪就被鎮在潭底，永不出來了。潭邊兩棵受靈氣孕育而成的樟樹，也被道士的法寶永遠的保護著，愛護著。
* 另一種說法是有一位婦人在鯉魚潭附近放魚籠捕魚，有一天晚上，婦人將一隻青蛙當做丈夫，放入魚籠中。當婦人將丈夫放回家時，她丈夫卻變成了魚人，青蛙因此成了花蓮的象徵。由於此婦人感動了鯉魚神明，使得附近的鯉魚會發大水來拯救青蛙，因此潭中有一隻鬼怪的故事。
以上鬼故事只是傳說，並沒有實際證據表明其存在。花蓮鯉魚潭以其清澈的潭水吸引了許多遊客前來觀賞。