若松孝二的代表作主要包括：
《甜蜜的圈套》（1963年），這是若松孝二導演的第一部作品。
《牆中秘事》（1965年），一部粉紅電影，入圍了第15屆柏林國際電影節主競賽單元。
《被侵犯的白衣》（1967年），劇情片，入圍第23屆坎城國際電影節「導演雙周」單元。
《赤軍/PFLP:世界戰爭宣言》（1971年），與足立正生聯合執導的紀錄片，因這一行為使若松孝二獲罪，被判處終生不得離開日本。
《感官世界》（1976年），情色電影，獲第29屆坎城國際電影節評審團大獎。
《無水之池》（1982年），情色電影。
《無盡的華爾茲》（1995年），傳記電影。
《沒有明天的街角》（1997年），犯罪電影。
《戀愛星期天》（2003年），純愛電視系列片。
《聯合赤軍實錄：通向淺間山莊之路》（2007年），以赤軍為主題的劇情片，在第58屆柏林國際電影節中獲得了最佳亞洲電影獎(NETPAC獎)和國際藝術電影評論聯盟獎(CICAE獎)。
《芋蟲》（2010年），劇情片，入圍第60屆柏林國際電影節金熊獎。
此外，若松孝二在2012年獲得第17屆釜山國際電影節亞洲年度電影人獎。