番茄剪側芽的方法和時機對番茄的產量和品質有重要影響，以下是詳細介紹：
剪側芽的最佳時間。在番茄苗生長到一定程度時進行，通常在側枝長到5厘米左右時修剪，對於美穗花類型的番茄，第一側枝應在長到3厘米左右時修剪。
剪側芽的正確方式。選擇合適的側枝，一般在主莖上生長的第2至3個節點上的側枝，因為這些側枝生長較強且不易影響主莖生長，使用剪刀將側枝剪除，注意不要剪傷主莖，剪口處的葉片和枝條要清理乾淨，避免病菌感染。
修剪後的處理。修剪後的番茄苗可以重新種植到適合它生長的土壤中，以加快生長速度。
此外，對於密蘇里州修剪法，可以直接掰掉側芽或掐掉側芽尖端，保留一兩片葉子，這樣可以讓植株獲得更大的葉面積進行光合作用，同時保護正在發育的果實免受陽光灼傷。