藍牙耳機的缺點主要包括：
信號範圍有限。藍牙耳機的有效工作距離通常只有十到十五米左右，這還是在沒有牆壁或電子設備干擾的理想條件下。
續航時間較短。由於需要內置電池，藍牙耳機的續航時間通常不如有線耳機，需要定期充電或攜帶充電設備。
音質相對較差。由於藍牙傳輸的帶寬限制，藍牙耳機的音質通常不如有線耳機，尤其是在高音部分可能會出現失真。
連接穩定性不足。藍牙耳機在信號干擾較多或距離較遠的情況下可能會出現連接不穩定或音頻中斷的情況。
設計可能導致耳朵不適。某些藍牙耳機的設計可能導致耳朵疼痛或不適，尤其是長時間佩戴時。
易丟失。由於藍牙耳機的便攜性，它們可能會更容易丟失。
價格相對較高。由於技術和功能的增加，藍牙耳機的價格通常高於有線耳機。
存在一定的健康風險。長期或不當使用藍牙耳機可能會對聽力造成損害，尤其是高分貝使用。
存在電磁干擾問題。藍牙耳機可能會受到周圍環境中其他無線電波的干擾。
隨着藍牙技術的發展，例如藍牙5.0的推出，藍牙耳機的連接穩定性、延遲性以及續航能力都有了顯著的提升。