蛋白質分子的尺寸通常在1到100納米（nm）之間。 蛋白質的分子量範圍廣泛，一般在6000到100萬道爾頓（Da）之間，分子量超過1000的通常被認為是大分子。不同類型的蛋白質分子大小不同，例如，牛血清蛋白分子的尺寸在4到14納米（nm）之間。