蛋白buffer在生物實驗中扮演著至關重要的角色，其主要作用包括：
指示劑作用：幫助觀察電泳進行的程度。溴酚藍等指示劑顯示電泳的進程，便於檢測上樣有無漏樣。
密度大：通過其成分（如甘油），幫助樣本沉入膠孔底部，確保樣本在電泳過程中能夠均勻分布。
保持蛋白線性及攜帶負電荷狀態：通過添加SDS（十二烷基硫酸鈉），使蛋白質帶上負電荷，確保蛋白質在電泳時能夠一致地向正極移動，從而公平比較不同蛋白質的遷移速度。
促進蛋白質變性：通過還原劑（如巰基乙醇或DTT），打開蛋白質中的二硫鍵，使蛋白質充分變性，有利於WB抗體識別抗原位點。這有助於消除蛋白質的不同空間結構對電泳速度的影響，確保蛋白質的遷移速度僅與其分子量相關。
蛋白buffer中的這些成分共同作用，確保了蛋白質樣品在電泳過程中的正確處理和觀察。