豆腐貓砂的缺點主要包括：
有豆腥味。有些貓咪可能不喜歡這種味道而排斥使用。
容易黏附在貓砂盆邊緣。清理起來可能比較費力。
容易受潮。在高溫高溼環境下，豆腐貓砂可能更容易滋生細菌。
吸水性差。特別是劣質豆腐貓砂，可能導致尿液無法迅速結團，容易產生難聞氣味。
可能含有有害物質。如甲醛超標或其他有害物質，對貓咪和人類健康構成潛在風險。
價格相對較高。雖然每天的成本可能不高，但初次購買的成本仍然存在。
顆粒較大。對於便便的包裹能力不足，且較大的顆粒可能不如礦石貓砂受歡迎。
選擇豆腐貓砂時，建議選擇質量好、無添加劑的產品，並注意儲存條件，以減少上述問題的發生。