赤崁樓的故事源於赤崁的荷蘭殖民時期。荷蘭殖民者曾把赤崁視為“危險區域”而強迫漢人遷居高地，並修築城牆圍住此地。當時，赤崁的漢人為了寄託對故鄉的思親之情，在寓所的牆上刷上“赤崁”二字。
後來，鄭成功在攻取台灣後，將赤崁改為“赤崁城”，後來城改為“赤崁樓”。樓建成以後，在樓內樓前街尾的巨型木質牌樓之間設立了鐫刻“赤崁”、“天南鎖鑰”四字的匾額，其含義是這裡是台灣最接近大陸的地方，是祖國的東南門戶。 赤崁樓成為重要的歷史文化遺蹟，是台灣人民反侵略、反殖民鬥爭的歷史見證。
這些故事在《台灣通史》中有詳細記載。希望這些信息對你有所幫助。