轉錄本是由一條基因通過轉錄形成的一種或多種可供編碼蛋白質的成熟的mRNA。一箇基因可以通過內含子的不同剪接構成不同的轉錄本。轉錄本實驗可以研究內含子剪切機制、表觀遺傳、RNA編輯等，通常是考察一條基因對應的不同轉錄本的調節機制等。