根據現有的法律規定，用人單位對於員工遲到並沒有具體的處罰措施。勞動法及其相關法律中並沒有明確規定遲到早退的處罰方式，也沒有授權用人單位對勞動者進行罰款。然而，用人單位可以依法建立和完善規章制度，自行制定遲到等行爲的處理方法。
如果員工遲到導致減少了工作時間，對於未提供勞動的部分，用人單位可以不支付工資，從固定工資中扣除。這意味着，如果員工遲到沒有給用人單位造成經濟損失，用人單位不能扣除工資作爲處罰。如果員工的遲到行爲給用人單位造成了經濟損失，用人單位可以要求員工賠償，賠償金額可以從員工的工資中扣除，但每月扣除的部分不得超過員工當月工資的20%，且扣除後的剩餘工資部分不得低於當地月最低工資標準。
總結來說，員工遲到，如果沒有給用人單位造成經濟損失，用人單位不能扣除工資作爲處罰。如果遲到導致了經濟損失，用人單位可以要求員工賠償，賠償金額可以從工資中扣除，但需遵守相關法律規定。