清洗醒酒瓶的方法有多種，可以根據個人情況和醒酒瓶的材質選擇合適的方法：
使用熱水或蘇打水。如果醒酒器不是特別髒，可以使用蘇打水清洗。蘇打水的泡沫能很好地清潔杯壁，只需將蘇打水倒入醒酒器中，搖晃後倒掉即可。如果紅酒漬較頑固，可以使用醒酒器內的小球輔助清潔，倒入少量水，使用小球摩擦杯壁，直至無污漬，然後倒掉多餘水分。
使用黃豆或綠豆。將醒酒器斜放，倒入100~200克黃豆或綠豆，加少量水，順時針和逆時針輕輕搖晃，上下移動，洗完後黃豆或綠豆可食用，並帶有酒香。
使用清水、白醋和碎冰塊。對於細頸寬肚的常規醒酒器，先用熱水沖洗，然後加入水和白醋的混合液體（可加冰塊），以畫圈方式搖晃瓶身，注意在有污漬的地方停留更久，之後用清水沖洗。
無論使用哪種方法，都應避免使用洗滌靈，因爲可能會在醒酒器內留下殘留物。