野生羊肚菌的特徵主要包括以下幾點：
帶泥角。野生羊肚菌採摘時通常帶有泥土，這些泥土與人工種植田地里的泥土不同。
個頭較小。野生羊肚菌的整體個頭通常比人工種植的要小。
大小不一。由於野生環境中生長，採摘時大小不一，形狀各異。
菌柄較細。野生羊肚菌的菌柄（菌腳）比人工種植的細。
菌角偏黃。野生羊肚菌的菌角顏色偏黃，而人工種植的菌腳通常是白色的。
菌帽顏色多變。野生羊肚菌的菌帽顏色在成熟過程中會從嫩時的偏黃變為成熟時的黑或黑黃相間。
形狀多樣。野生羊肚菌的形狀大小不規則，有偏黑色、黃色、黑黃相間或者是灰色的。
菌壁厚實。野生羊肚菌的菌壁厚實，有的品種甚至有雙層甚至三層的莖。