金碧峰禪師的故事有很多，以下是一些常見的版本：
1. 拒供養：據說寺廟裡的香火鼎盛，信徒供養了很多珍寶，但金碧峰禪師一無所用，將供養悉數推回，勸眾人將珍寶供養家中，以解生老病死苦之憂。
2. 伏虎：金碧峰禪師在任期間，有一隻猛虎為患，禪師便現出神通，手捧這隻猛虎，為眾人消除禍害。
3. 枯木逢春：金碧峰禪師一派仙風道骨、神秘莫測的樣子。曾在一枯木中打出了一枝鮮花，神奇地給人一種美的享受。
4. 老病之月：年邁體弱時，禪師總是正襟危坐面對南壁，毫無顧忌。有一次一個年輕人疑惑地問他其中的道理，他說那是他自己房裡的東西，只有死到臨頭才肯示人。年輕人大吃一驚，回去後告訴眾人。於是第二天大家紛紛前來觀看，卻發現禪師已經圓寂了。
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