阿奎那的著作集包括《哲學基礎》、《宇宙間的靈智實體問題》、《論真原》、《論萬物》、《論萬事》和《論奧理》。
其中，《神學大全》（Summa Theologica）是他最著名的作品，創作於1266年至1273年。這部作品分為三個部分，分別是上帝論、倫理學和教理神學，外加一個補編。上帝論主要涉及理論哲學，倫理學分為一般倫理學和特殊倫理學，主要探討實踐哲學，而教理神學和補編則主要關注教理神學和信仰真理。這部作品在教理神學方面超越了教父哲學，在實踐哲學和理論哲學方面也對古希臘羅馬哲學有所超越，因其創新和精深的思想，成為了中世紀教理神學、自然神學、理論哲學和實踐哲學的思想高地。