阿富汗戰爭的起因是多方面的，主要包括：
地緣政治因素。阿富汗位於南亞、中亞、西亞的交界處，具有重要的地緣戰略地位。蘇聯爲了維護其在這一地區的利益，於1979年入侵阿富汗，這場戰爭最終以蘇聯的失敗告終，留下了動盪不安的阿富汗。
宗教極端主義。阿富汗主要信仰伊斯蘭教，其中塔利班是一種極端的宗教思想的代表。他們在1996年至2001年間掌握了阿富汗的政權，實施嚴格的沙利亞法，且與國際上的恐怖主義組織有所聯繫。
9·11恐怖襲擊事件。2001年9月11日，美國發生了震驚全球的恐怖襲擊事件，極端主義組織阿爾-qaeda聲稱對此負責，而該組織被認爲受到了阿富汗塔利班政權的庇護。這使得美國在對恐怖主義的全球戰爭中，將阿富汗視爲首要目標，美國在2001年10月發動了對阿富汗的軍事行動。
這些因素共同導致了阿富汗戰爭的爆發和持續至今的衝突。