阿巴嘎部是蒙古部落名，源自蒙古語，意為「叔叔」。這個部落是由成吉思汗的同父異母弟別里古台的後裔所率領的。
阿巴嘎部原屬於察哈爾部，最初遊牧於今天的錫林郭勒盟阿巴嘎旗一帶。在17世紀初，由於林丹汗的威脅，部分族人一度遷往喀爾喀部。1639年，該部首領多爾吉率眾歸附清朝。1649年，札薩克卓日格圖郡王被授予掌管左翼旗，而都思嘎爾在1651年歸附清朝後，被授予札薩克多羅郡王，掌管右翼旗。
隨著時間的推移，阿巴嘎部與阿巴哈納爾部經過幾次分合，最終形成了現在的阿巴嘎旗。阿巴嘎旗位於內蒙古自治區錫林郭勒盟中北部，北與蒙古國有較長的國界線。這個地區的歷史可以追溯到古代，經歷了多次歸屬和行政變更，最終在1963年形成了現在的行政區域。