雞啄羽啄肛的原因可能包括以下幾點：
營養不均衡。如缺乏蛋白質、胺基酸、礦物質、維生素等。
飼養管理不當。如雞舍通風不良、濕度過大、糞便清理不及時，導致的空氣污濁；飼養密度過大、雞籠設計不合理、光照強度過大、缺乏運動等。
疾病原因。如雞球蟲病、雞痘、雞羽虱等寄生蟲病；雞大腸桿菌病、雞霍亂等。
環境因素。如雞舍光照過強、時間過長；雞舍溫度過高、通風不好；雞群密度過大。
性成熟過早導致產雙黃蛋多。使泄殖腔翻出狀態維持時間較長，增加啄食機會。
此外，還有黴菌毒素中毒、產蛋時間延長等因素。針對這些原因，可以通過改善飼養環境、調整飼料配方、加強疾病預防和管理等措施來減少啄羽啄肛現象的發生。