雨花石的形成是一個複雜且漫長的地質過程，具體可參考如下：
大約250萬年至150萬年前，地球深處的熾熱岩漿涌動，這些岩漿富含礦物質。隨著岩漿冷卻固化，它形成了各種岩石。
在岩漿冷卻過程中，會形成含有孔洞的岩石。隨後，地下水沿著這些孔洞滲透進入岩石內部，將岩石中的二氧化矽慢慢分離出來，與水中的礦物質一起沉積，形成了石英、玉髓和燧石或蛋白石的混合物。
古長江從上游沖刷剝落了石頭，這些石頭在水流搬運過程中被打磨圓潤。硬度較低的石頭在這個過程中徹底消失，而較硬的石頭則在水流平緩或拐彎的地方沉積下來，形成了卵石。其中，最漂亮的卵石就是我們所說的雨花石。