鞋子除菌的方法有多種，主要包括：
使用鞋子殺菌除臭器。這是一種專門設計的小家電，具有殺菌、除臭等功能。它採用能產生臭氧的優質紫外線消毒殺菌燈，可以有效殺菌並分解異味。
使用酒精噴灑。在鞋底均勻噴灑酒精可以殺滅真菌，因為酒精具有強氧化作用，可以殺菌同時分解異味。
陽光暴曬。陽光中的紫外線具有殺菌效果，可以殺死真菌。但需要注意鞋子材質，避免長時間暴曬導致鞋子老化。
定期清洗。使用清水或家用消毒水清洗鞋子，並確保鞋子完全乾燥。
選擇合適的鞋墊。如具有抗菌、吸濕、透氣等功能的鞋墊。
藥物消毒。如使用次氯酸鈉消毒液、高錳酸鉀溶液等，將鞋子浸泡進行殺菌。
沸水洗滌。對於耐高溫的鞋子，可以用沸水煮沸殺菌。
此外，還有使用消毒櫃、藥物噴劑、樟腦球等方法。選擇具體的除菌方法時應考慮鞋子的材質、個人足部健康狀況以及個人偏好。同時，定期清潔和保持鞋子乾燥也是預防細菌和真菌生長的重要措施。