鞭毛染色方法主要用於顯示細菌的鞭毛，這些方法包括硝酸銀法、Leifson氏法、鹼性復紅法、副品紅法、結晶紫法和螢光蛋白染色法等。其中，硝酸銀法的操作步驟如下：
使用潔淨的載玻片。
配製染料，包括A液和B液。A液為丹寧酸、FeCI3、蒸餾水的混合物，B液為AgNO3、蒸餾水的混合物。
準備菌液並製作塗片，使用運動力強的菌種，如普通變形桿菌，在合適培養基上培養後製成懸液。
染色，先滴加A液染4至6分鐘，然後用蒸餾水洗淨。接著滴加B液，在微火上加熱0.5至1分鐘（不使乾涸），最後用蒸餾水洗淨自然乾燥。
使用油鏡觀察，此時菌體與鞭毛呈深褐至黑色。
不同的染色方法使用的染料和步驟有所不同，但主要原理是利用媒染劑和染色劑的沉澱作用，使鞭毛直徑加粗，便於觀察。在進行染色過程中需要注意菌體的培養條件和時間、塗片的製備、染液的配製和染色細節等，以確保染色效果。