鞭毛染色法是用於觀察細菌鞭毛形態和結構的方法，根據染色劑的不同，可以分為多種類型，如鹼性復紅法、副品紅法、結晶紫法、維多利亞藍B法、鍍銀染色法和螢光蛋白染色法等。這些方法中，前五種方法的媒染劑成分中通常含有單寧酸，其染色原理是利用不穩定的膠體溶液作為媒染劑，使其沉澱於鞭毛上，使鞭毛變粗，便於後續觀察。
一種常見的鞭毛染色方法是硝酸銀法，其操作步驟包括使用特定的染料溶液對細菌進行染色，具體過程為在潔淨的載玻片上製備菌液塗片，先滴加含丹寧酸和鐵鹽的溶液進行染色，然後用硝酸銀溶液進行染色，最後用氫氧化鈉溶液處理，使鞭毛變得可見。
另一種改良後的鞭毛染色方法採用鹼性復紅和鹼性美蘭進行染色，這種方法可以使菌體和鞭毛分別呈現不同的顏色，便於觀察。但該方法的效果可能受到細菌在雙蒸水中舒展膨脹時間的影響。
總體來說，鞭毛染色法的發展經歷了多個階段，從最初的Gray法和Leifson法到後來的改良方法，如Clark法等，這些方法的改進提高了染色的效率和效果。