馬祖列島以其獨特的文化和自然景觀而聞名，主要特色包括：
豐富的閩東人文特色。馬祖保留了獨特的閩東建築、生活方式、語言習慣和宗教信仰，構成了一種獨特的文化景觀。
獨特的自然景觀。馬祖地形多山丘，擁有壯觀的海岸線和晨曦景色，特別是燕鷗的故鄉，其中黑嘴端鳳頭燕鷗尤爲著名。
戰地風光。馬祖曾是軍事要地，因此保留了許多戰地相關的景點，如坑道和炮臺。
獨特的飲食文化。馬祖的飲食文化深受福州影響，特色美食包括蠣餅、繼光餅、鼎邊糊（鍋邊糊）、老酒蛋面、海蠣餅、淡菜和魚面等。這些食物不僅美味，而且反映了當地的生活方式和海鮮資源。