麪粉發黴的原因主要包括：
受潮。麪粉如果儲存環境不當，吸收了水分，會導致結塊，從而爲黴菌提供生長條件。
高溫和高溼環境。特別是在夏季，這樣的環境條件會加速麪粉的黴變過程。
包裝不當。如果麪粉包裝密封不嚴，也會導致麪粉容易受潮和發黴。
原糧品質問題。如原糧脂肪酸含量過高，或小麥加工工藝不當，也可能導致麪粉容易發黴。
生蟲。小麥生蟲後，微生物的呼吸及其糞便也可能使麪粉發黴。
水分含量高。麪粉本身的水分含量過高，特別是在超過保質期的情況下，水分增加會導致黴變。
黴菌在麪粉中生長時，不僅會產生黴斑和結塊，降低麪粉的品質，還可能產生黴菌毒素，如黃麴黴毒素和鐮刀菌毒素，這些毒素肉眼難以察覺，但可能對人體健康造成危害。